هوای شهرهایی که در کوه و دره های بینالود واقع شده اند سرد است. هوای بخشهای بارو سرولایت، قدمگاه، قدیشه و حومه معتدل است. شهرهای جنوبی شهرستان نیشابور گرمسیر و شوره زار است.

آب و هوای شمال و جنوب شهرستان نیشابور با یکدیگر متفاوت است. تابستان های گرم و خشک و زمستانهای سرد و کوتاه از خصوصیات آب و هوایی نیشابور می باشد.

در شمال شهرستان به دلیل کوهستانی بودن آن هوای سرد حکم فرما است. در فصل بهار و پاییز به دلیل وزش بادهای شدید موسمی و محلی زمین های کشاورزی دچار آسیب و آفت می شوند.

یکی از دلایل تفاوت آب و هوا در شهرستان نیشابور؛ وسعت بسیار آن است.